Препарати багульника надають відхаркувальну, бактерицидну, протикашльову та протиалергічну дію. Показані при гострому та хронічному бронхітах, бронхіальній астмі, кашлюку. Іноді багно призначають при спастичних ентероколітах. Олія багульнику ефективна для лікування грипу та гострих ринітів.
У народній медицині водний настій трави баульника застосовували при туберкульозі легень, лихоманці, ревматизмі, подагрі, золотусі.
Рослина слабоотруйна. Неправильне дозування може спричинити запалення слизової оболонки шлунково-кишкового тракту. Використовується в гомеопатії для лікування захворювань суглобів та остеохондрозів.