Трава чебрецю повзучого містить до 0,1-0,6% ефірної олії, основним компонентом якої є тимол – до 30%. У траві виявлені також дубильні речовини, гіркоти, мінеральні солі, камедь, барвники, урсолова та олеїнова кислоти. У незначних кількостях є терпеливі.
Фармакологічні властивості трави чебрецю пов’язують в основному з тимолом, що відноситься до похідних фенолу. На відміну від фенолу тимол менш токсичний, менше подразнює слизові оболонки, має бактерицидну дію на кокову флору. Активний щодо патогенних грибів, стрічкових глистів та волосоголовця.
Препарати чебрецю мають дезінфікуючу, відхаркувальну, сечогінну, протиспастичну та заспокійливу властивості. Тимьян використовують як глистогінний та сечогінний засіб, він регулює місячні. Дуже корисний при захворюваннях нирок, сухому спастичному кашлі, кашлюку, бронхіті, бронхіальній астмі, запаленні легень, хронічному катарі шлунка, порушенні травлення, метеоризмі, відрижці, проносах, виразковій хворобі шлунка та дванадцятипалої кишки, безсонні, нерві.